軟件與微電子學院前身是軟件學院，成立于 2003年4月，是黑龍江省首批兩所省級示範性軟件學院之一和全省高校三所試點學院之一。建院以來，以“面向行業、校企協同、機制創新、突出特色、提高質量”為辦學指導思想，不斷深化改革，人才培養質量持續提升。2005年軟件學院被黑龍江省教育廳确定為振興東北老工業基地計算機軟件人才培訓中心。2008年學院分别被黑龍江省信息産業廳和哈爾濱市信息産業局确定為首批省級和市級服務外包人才培養培訓基地。2009年學院被黑龍江省教育廳确定為黑龍江省人才培養模式創新實驗區。同年以軟件學院為主要參加單位的“面向東北老工業基地‘定制式’人才培養模式的探索與實踐” 項目獲國家級教育成果二等獎。2012年學院獲第一屆黑龍江省普通高校教學管理質量獎。2014年學院榮獲黑龍江省 “三育人”先進集體稱号。
目前以新技術、新業态、新産業、新模式為特點的新經濟和新産業蓬勃發展，迫切需要大批新興工程科技人才，全世界高等工程教育面臨新機遇、新挑戰。2017年教育部組織高校共同研讨工程教育發展戰略，形成了新工科建設的“三步曲”，即“複旦共識”、“天大行動”和“北京指南”。學校為了實施新工科建設，對學科專業進行優化調整，把微電子科學與工程、電子科學與技術和物聯網工程三個專業調整到軟件學院，其中微電子科學與工程專業和原軟件學院的集成電路設計與集成系統專業合并為集成電路設計與集成系統專業，更名為軟件與微電子學院，并被學校确定為bevictor伟德官网“新工科”試點學院，作為“新工科”建設的示範區，為學院又一次帶來了重大發展機遇。
目前軟件與微電子學院擁有軟件工程和電子科學與技術兩個一級學科碩士學位授權點，一個集成電路工程專業碩士學位授權點；設有軟件工程、集成電路設計與集成系統、電子科學與技術和物聯網工程四個本科專業，其中軟件工程專業和電子科學與技術專業為黑龍江省重點專業和卓越工程師教育試點專業。
