軟件工程專業2003年開始招生，2004年正式獲教育部批準。2010年被評為黑龍江省重點專業，2011年被評為黑龍江省“卓越工程師教育培養計劃”試點專業，2012年被評為黑龍江省“專業綜合改革試點”專業。本專業參與的教研項目《面向東北老工業基地“定制式”人才培養模式的研究與實踐》獲國家教學成果二等獎，主持的教研項目《省級示範性軟件學院人才培養模式的探索與實踐》獲黑龍江省高等教育教學成果一等獎。
多年來，軟件工程專業積極開展校企合作，以社會需求和“主流技術崗位目标需求”為導向，以學生發展為本位，形成了“2年通識與學科基礎教育，1年專業教育，1年校企聯合實踐培養”的“2+1+1”人才培養模式和“定制式”就業模式。本專業緻力于培養具有紮實的數學、自然科學、軟件工程專業基礎知識和人文社會科學素質、自主學習能力、創新意識和團隊合作精神，能夠适應軟件産業發展的需求，勝任軟件系統的分析、設計、實現、測試、維護和管理等工作，成為軟件工程領域具有國際視野的應用型、複合型高級人才。本專業的人才培養質量獲得了學生、家長和用人單位的好評，畢業生一次就業率平均在90%以上。截止到2017年7月，軟件工程專業已培養12屆本科畢業生共計2600餘人，現有全日制在校本科生1117人，目前許多畢業生工作在國内知名軟件企業并成為業務骨幹。
